Sạch sẽ là một yếu tố thiết yếu và quan trọng để đảm bảo hiệu quả của tủ an toàn sinh học.Làm sạch thường xuyên giúp duy trì sự sạch sẽ, giảm khả năng lây lan của các hạt có hại, vi khuẩn và các chất gây ô nhiễm khác.

Vật liệu được sử dụng để xây dựng tủ an toàn sinh học phải chống ăn mòn, dễ làm sạch và không xốp để ngăn chặn sự phát triển của vi khuẩn.Các vật liệu cũng phải đủ bền để chịu được các quy trình làm sạch và khử nhiễm cần thiết.

Toàn bộ BSC phải đáp ứng các tiêu chuẩn quốc tế quy định, bao gồm ISO 14644-1 và EN1822.Các tủ phải được kiểm tra thường xuyên và tài liệu thích hợp về kiểm tra và vệ sinh phải được cung cấp theo yêu cầu.

Sự sạch sẽ và vật liệu được sử dụng trong việc xây dựng tủ là một trong những yếu tố quan trọng nhất để đảm bảo sự thành công và an toàn của các thí nghiệm được thực hiện.